Die Forschungsaktivitäten am ZeMKI sind in Form von Arbeitsgruppen organisiert: den ZeMKI-Labs. Aufgabe der Labs ist die Realisierung von Grundlagen- und Anwendungsforschung im interdisziplinären Gesamtforschungsfeld des ZeMKI.
Diverse Projekte der ZeMKI-Labs verfolgen über ihr jeweiliges Forschungsziel hinaus eine Verbesserung digitaler Infrastrukturen für Forschung, Lehre und Wissenschaftstransfer.
ZeMKI-Mitglieder engagieren sich mit ihren fachwissenschaftlichen und interdisziplinären Forschungsperspektiven in unterschiedlichen Forschungsverbünden.